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基于代謝組學的NWMN_0037調控金黃色葡萄球菌持留形成及毒力的機制研究

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基于代謝組學的NWMN_0037調控金黃色葡萄球菌持留形成及毒力的機制研究
論文目錄
 
摘要第1-6頁
Abstract第6-13頁
第一章 研究背景第13-18頁
  1.1 前言第13頁
  1.2 持留菌及其與疾病的關系第13-14頁
  1.3 持留菌形成可能的機制第14-15頁
    1.3.1 毒素/抗毒素(toxin/antitoxin,TA)系統第14頁
    1.3.2 細胞代謝和能量產生的影響第14-15頁
    1.3.3 生物被膜促進持留菌形成第15頁
    1.3.4 氧化應激誘導第15頁
    1.3.5 其他機制如化學信號機制、反式翻譯機制等第15頁
  1.4 金黃色葡萄球菌的主要毒力因素第15-16頁
  1.5 代謝組學概述及主要應用第16頁
  1.6 本研究的目的和意義第16-18頁
第二章 實驗材料與方法第18-32頁
  2.1 實驗菌株第18頁
  2.2 主要試劑和材料第18-19頁
  2.3 主要儀器第19頁
  2.4 主要實驗方法第19-30頁
    2.4.1 抗生素的配制第19-20頁
    2.4.2 主要的培養基配制第20頁
    2.4.3 主要試劑的配制第20-21頁
    2.4.4 抗菌藥物暴露下金黃色葡萄球菌野生株、突變株及回補株的生長比較第21頁
    2.4.5 金黃色葡萄球菌野生株、突變株代謝組學樣品準備第21-22頁
    2.4.6 代謝組學樣品預處理第22頁
    2.4.7 質控樣本(QC)的制備第22頁
    2.4.8 色譜-質譜分析第22-23頁
    2.4.9 金黃色葡萄球菌野生株、突變株及回補株總RNA的提取第23-24頁
    2.4.10 實時熒光定量PCR檢驗金黃色葡萄球菌碳水化合物代謝通路基因表達變化第24-28頁
    2.4.11 金黃色葡萄球菌野生株、突變株及回補株總蛋白的提取第28-29頁
    2.4.12 金黃色葡萄球菌野生株、突變株及回補株乳酸脫氫酶(LDH)檢測第29頁
    2.4.13 實時熒光定量PCR檢驗金黃色葡萄球菌毒力相關基因表達變化第29-30頁
    2.4.14 金黃色葡萄球菌野生株、突變株及回補株血漿凝固酶試驗對比第30頁
  2.5 數據處理分析第30-32頁
    2.5.1 qPCR結果數據分析第30-31頁
    2.5.2 細菌LDH濃度測定結果數據分析第31-32頁
第三章 結果第32-95頁
  3.1 金黃色葡萄球菌野生株、突變株和回補株不同培養時間點對藥物的敏感性第32-33頁
  3.2 代謝組檢測結果第33-88頁
    3.2.1 實驗質量控制第33-35頁
    3.2.2 各組樣本的代謝譜圖第35-39頁
    3.2.3 數據分析第39-49頁
    3.2.4 顯著差異代謝物第49-61頁
    3.2.5 差異代謝物生物信息學分析第61-88頁
  3.3 金黃色葡萄球菌總RNA提取后凝膠電泳結果第88頁
  3.4 金黃色葡萄球菌野生株、突變株及回補株參與糖代謝主要基因表達水平qPCR檢測結果第88-92頁
  3.5 金黃色葡萄球菌野生株、突變株及回補株LDH檢測結果第92-93頁
  3.6 金黃色葡萄球菌野生株、突變株及回補株主要毒力基因表達水平qPCR檢測結果第93-94頁
  3.7 金黃色葡萄球菌野生株、突變株及回補株血漿凝固酶試驗結果第94-95頁
第四章 討論第95-102頁
  4.1 NWMN_0037對金黃色葡萄球菌代謝的整體影響第95-96頁
  4.2 NWMN_0037對金黃色葡萄球菌糖酵解/糖異生和TCA途徑的影響第96-98頁
  4.3 NWMN_0037對金黃色葡萄球菌甘油磷脂代謝的影響第98-99頁
  4.4 NWMN_0037對金黃色葡萄球菌核苷酸代謝的影響第99-100頁
  4.5 NWMN_0037對金黃色葡萄球菌毒力的調控第100-102頁
第五章 結論第102-103頁
參考文獻第103-109頁
在學期間的研究成果第109-110頁
中英文對照縮略詞表第110-111頁
致謝第111頁

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