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兩種草原毛蟲腸道菌多樣性的比較分析

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兩種草原毛蟲腸道菌多樣性的比較分析
論文目錄
 
中文摘要第1-5頁
Abstract第5-10頁
前言第10-12頁
第一章 文獻綜述第12-19頁
  1.1 昆蟲腸道菌研究概況第12-19頁
    1.1.1 昆蟲腸道菌影響因素第13-14頁
    1.1.2 腸道菌種類第14-15頁
    1.1.3 昆蟲腸道菌的生物學功能第15-17頁
    1.1.4 昆蟲腸道菌研究方法第17-19頁
第二章 材料與方法第19-28頁
  2.1 試驗材料第19-22頁
    2.1.1 供試昆蟲第19頁
    2.1.2 主要試劑、培養基的配置第19-22頁
    2.1.3 主要儀器及設備第22頁
  2.2 試驗方法第22-28頁
    2.2.1 草原毛蟲腸道解剖第22-23頁
    2.2.2 草原毛蟲腸道菌基因組DNA提取第23頁
    2.2.3 草原毛蟲腸道菌的鑒定及生物學特性研究第23-24頁
    2.2.4 草原毛蟲腸道菌的理化性質第24-25頁
    2.2.5 草原毛蟲腸道菌16S擴增子測序第25-26頁
    2.2.6 草原毛蟲腸道菌宏基因組測序第26-28頁
第三章 結果與討論第28-68頁
  3.1 草原毛蟲腸道細菌的分離、培養及鑒定第28-32頁
    3.1.1 腸道解剖第28頁
    3.1.2 腸道菌分離培養第28-30頁
    3.1.3 分離菌株16S rDNA克隆及測序第30-32頁
  3.2 基于16S rDNA草原毛蟲腸道細菌V4-V5 區擴增子測序結果分析第32-50頁
    3.2.1 草原毛蟲腸道細菌原始數據統計第32頁
    3.2.2 序列拼接第32頁
    3.2.3 物種分類和豐度分析第32-39頁
    3.2.4 物種熱圖分析第39-41頁
    3.2.5 物種系統進化分析第41-42頁
    3.2.6 兩種草原毛蟲樣品α多樣性分析第42-44頁
    3.2.7 兩種草原毛蟲腸道菌的差異性分析第44-46頁
    3.2.8 物種間多樣性比較分析第46-48頁
    3.2.9 LEFSe分析第48-50頁
  3.3 草原毛蟲腸道菌宏基因組測序結果分析第50-61頁
    3.3.1 腸道解剖及DNA提取結果第50-51頁
    3.3.2 腸道宏基因組的測序及組裝第51-52頁
    3.3.3 草原毛蟲腸道宏基因組基因功能注釋第52-55頁
    3.3.4 腸道菌的物種組成及豐度分析第55-61頁
    3.3.5 物種多樣性分析第61頁
  3.4 討論第61-68頁
    3.4.1 腸道菌研究方法第61-64頁
    3.4.2 草原毛蟲腸道菌多樣性第64-65頁
    3.4.3 兩種草原毛蟲腸道菌差異分析第65-66頁
    3.4.4 重要菌功能第66-68頁
第四章 結論與展望第68-70頁
  4.1 主要結論第68頁
  4.2 研究展望第68-70頁
參考文獻第70-78頁
附錄第78-80頁
在學期間的研究成果第80-81頁
在學期間參與的科研項目第81-82頁
致謝第82頁

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