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綿羊Y染色體基因的鑒定和SNPs篩選

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綿羊Y染色體基因的鑒定和SNPs篩選
論文目錄
 
中文摘要第1-5頁
Abstract第5-11頁
第一章 文獻綜述第11-20頁
  1.1 Y染色體結構第11-14頁
    1.1.1 人Y染色體序列研究進展第11-12頁
    1.1.2 牛Y染色體第12-13頁
    1.1.3 綿羊Y染色體第13-14頁
    1.1.4 其他動物Y染色體研究第14頁
  1.2 Y染色體基因的功能第14-16頁
    1.2.1 性別決定第14-15頁
    1.2.2 雄性生殖方面的作用第15-16頁
    1.2.3 其他功能第16頁
  1.3 Y染色體基因的表達研究第16-17頁
  1.4 Y染色體多態性研究第17-18頁
    1.4.1 Y染色體單核苷酸多態性及微衛星標記第17-18頁
    1.4.2 Y染色體拷貝數與公畜繁殖性狀的關聯分析第18頁
  1.5 本研究的目的和意義第18-19頁
  1.6 研究內容第19頁
  1.7 技術路線第19-20頁
第二章 綿羊Y染色體基因SNPs檢測第20-47頁
  2.1 實驗材料第20-21頁
    2.1.1 實驗動物第20頁
    2.1.2 實驗動物繁殖性狀數據的收集第20-21頁
    2.1.3 主要儀器設備及試劑第21頁
  2.2 實驗方法第21-25頁
    2.2.1 基因組DNA的提取第21頁
    2.2.2 混合池的構建第21-22頁
    2.2.3 綿羊Y染色體特異性引物的篩選第22-24頁
    2.2.4 綿羊Y染色體特異性基因片段SNPs篩選第24頁
    2.2.5 Y染色體基因的RFLP第24頁
    2.2.6 數據處理與統計分析第24-25頁
  2.3 結果第25-42頁
    2.3.1 綿羊基因組DNA的檢測第25頁
    2.3.2 綿羊Y染色體特異性引物第25-28頁
    2.3.3 綿羊Y染色體特異性DNA片段與其他物種的同源性分析第28-32頁
    2.3.4 綿羊SRY基因CDS序列分析第32-34頁
    2.3.5 綿羊Y染色體SNPs的篩選及基因效應分析第34-41頁
    2.3.6 Y染色體單倍型第41-42頁
  2.4 討論第42-46頁
    2.4.1 AMELY基因序列分析第42頁
    2.4.2 EIF2S3Y基因序列分析第42頁
    2.4.3 SRY基因SNPs及其與繁殖性能的關聯性分析第42-43頁
    2.4.4 USP9Y基因序列分析第43-44頁
    2.4.5 UTY基因序列分析第44頁
    2.4.6 ZFY基因序列分析第44-45頁
    2.4.7 SNPs與繁殖性狀相關性分析第45頁
    2.4.8 Y染色體單倍型分析第45-46頁
  2.5 小結第46-47頁
第三章 湖羊DDX3Y基因序列的擴增及表達分析第47-62頁
  3.1 實驗材料第47頁
    3.1.1 實驗動物第47頁
    3.1.2 主要儀器設備及試劑第47頁
  3.2 實驗方法第47-51頁
    3.2.1 總RNA的提取第47-48頁
    3.2.2 反轉錄第48頁
    3.2.3 引物設計第48-50頁
    3.2.4 DDX3Y基因全長的擴增第50頁
    3.2.5 DDX3Y基因mRNA全長的擴增第50頁
    3.2.6 Real time PCR第50頁
    3.2.7 數據分析第50-51頁
  3.3 結果與分析第51-59頁
    3.3.1 湖羊總RNA的檢測第51頁
    3.3.2 DDX3Y基因全長擴增第51-53頁
    3.3.3 DDX3Y基因mRNA全長擴增及序列分析第53-56頁
    3.3.4 湖羊DDX3Y蛋白生物信息學分析第56-58頁
    3.3.5 DDX3Y基因表達特征第58-59頁
  3.4 討論第59-61頁
    3.4.1 DDX3Y基因第59-60頁
    3.4.2 DDX3Y基因序列分析第60頁
    3.4.3 DDX3Y基因mRNA序列分析第60-61頁
    3.4.4 DDX3Y基因的的表達特征分析第61頁
  3.5 小結第61-62頁
第四章 湖羊Y染色體特異性基因表達特征分析第62-69頁
  4.1 材料及方法第62頁
    4.1.1 實驗動物第62頁
    4.1.2 儀器設備及試劑第62頁
  4.2 實驗方法第62-63頁
    4.2.1 總RNA的提取及RNA質量檢測第62頁
    4.2.2 RT-PCR、引物設計及Real time PCR第62-63頁
    4.2.3 數據分析第63頁
  4.3 結果與分析第63-67頁
    4.3.1 Y染色體特異性引物的鑒定第63-64頁
    4.3.2 Y染色體基因在湖羊不同組織中的表達第64-65頁
    4.3.3 Y染色體基因在湖羊不同月齡睪丸組織中的表達第65-66頁
    4.3.4 Y染色體基因在湖羊不同大小睪丸中的表達第66-67頁
  4.4 討論第67-68頁
  4.5 小結第68-69頁
第五章 結論及創新點第69-70頁
  5.1 結論第69頁
  5.2 創新點第69-70頁
參考文獻第70-78頁
附錄第78-91頁
附錄1 綿羊Y染色體非特異性引物第78-81頁
附錄2 總RNA提取第81-82頁
附錄3 湖羊DDX3Y基因CDS序列第82-84頁
附錄4 湖羊DDX3Y基因全長序列第84-91頁
在學期間的研究成果第91-92頁
致謝第92頁

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